Klíčovými spojenci při pěstování rostlin jsou půdní bakterie a kořenové houby (mykorhizní houby). Tyto mikroorganismy zlepšují dostupnost živin, podporují rozvoj kořenového systému a zvyšují odolnost rostlin vůči stresovým podmínkám, jako je sucho nebo nedostatek minerálních látek. Půdní bakterie, například z rodu Rhizobium, fixují dusík a přeměňují ho na formu, kterou rostliny snadno využijí. Mykorhizní houby vytvářejí symbiotické vztahy s kořeny, díky čemuž zajišťují lepší příjem fosforu a dalších minerálních látek. Společně půdní bakterie a houby zlepšují strukturu půdy, zvyšují její úrodnost a přispívají k celkovému zdraví pěstebního prostředí.
